知网作为一款常用的查重工具，为了确保学术诚信和文献原创性，会在查重过程中过滤掉参考文献内容。这是因为在学术论文中，参考文献通常不计入重复率，因此查重工具会将其排除在外。这种设计是为了更准确地评估论文的原创性和独特性。但有时候，用户可能希望保留参考文献信息，这就需要在使用查重工具时进行特殊设置或处理。

知网查重过滤参考文献主要是为了确保学术作品的独特性和原创性，避免因引用他人文献而导致重复率过高。这对于学术界的学术诚信和学术评价非常重要。如果用户需要保留参考文献信息，可以在使用查重工具时选择特殊设置，或者在查重后手动添加参考文献信息，以确保最终文档的完整性和准确性。